天天养生

利用DNAMAN软件进行核酸序列比对与分析的方法与技巧

2023-08-30 09:29:06
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下载好 DNAMAN 8 的软件,并打开。

第一栏为主菜单栏,除了帮助菜单外,有十个常用主菜单第二栏为工具栏第三栏为浏览器栏。打开File-New,将序列粘贴到弹出的窗口中,点击File-save,保存到指定的文件夹。

将所需比对的序列保存好以后,选中Sequence—Aligment—Multiple aligment sequence进行多序列比较。

在弹出的窗口Sequence&Files中加载序列,File、Fold、channel、Database分别表示从文件、文件夹、channel和数据库中获取序列。勾选窗口中的“DNA”,点击“下一步”。

在弹出的窗口Method中,“optimalaligment”最佳比对方式中有四个高大上的选项:Full Alignment(完全比对)、 Prosile Aligment(轮廓比对)、 New Swquence on Profile (轮廓上的新序列)、Fast Alignment(快速比对),本文选择了Fast Alignment,并且勾选了Try both strands(尝试使用双链)。其他项目不需修改,默认就OK,点击“下一步”。

Duang”,结果就出来啦!点击“Option”可以选择要显示的内容。

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网友评论
显示评论内容(3) 收起评论内容
  1. 2024-02-17 20:40〃西城决 转身一世琉[西藏网友]103.228.31.48
    DNAMAN的对比功能真的很强大,能够帮助我们快速分析核酸序列的差异,非常感谢分享这个工具。
    顶8踩0
  2. 2023-12-22 16:56*勿语*[重庆市网友]203.9.32.98
    使用DNAMAN对比核酸序列,可以快速找到序列之间的相似性和差异,非常实用。
    顶49踩0
  3. 2023-10-26 13:12阿利巴巴[四川省网友]210.74.237.116
    DNAMAN是一个非常方便易用的工具,对比核酸序列非常方便快捷,适合初学者使用。
    顶0踩0
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